Для изменения значения ячейки в pandas можно используйте методы df.loc[] или df.iloc[].
import pandas as pd
data = {'A': [1, 2, 3],
'B': [4, 5, 6],
'C': [7, 8, 9]}
df = pd.DataFrame(data)
# Изменение значения ячейки во 2-й строке и 3-м столбце
df.loc[1, 'C'] = 10